Rui Mota, treinador dos serranos, realizou diversas mexidas no onze inicial para a receção ao Amora, num jogo que serviu para cumprir calendário para as duas equipas. À entrada para a partida, o conjunto de Setúbal já estava despromovido ao Campeonato de Portugal, enquanto o Covilhã sabia que contava com a permanência na Liga 3 na
próxima temporada.
A equipa da casa sofreu um golo de Ednilson Furtado aos 79 minutos, mas garantiu o empate por via de Cheikh Niang ao cair do pano. Assim o confronto terminou empatado, numa tarde que ficou marcada por uma guarda de honra realizada pelos jogadores de ambas as equipas a Igor Araújo, guarda-redes de 39 anos do SC Covilhã que se reformou após vinte épocas a defender o emblema dos leões da serra.
A temporada desportiva 2025/26 ficou marcada para os adeptos do Covilhã como uma resistência à descida de divisão. Após o último lugar no Grupo B da Liga 3, com apenas 14 pontos em 18 jogos, os serranos disputaram a fase de manutenção. Abriram esta etapa com três vitórias consecutivas, permitindo um maior alívio. De seguida, sofreram duas derrotas seguidas no Estádio Municipal José dos Santos Pinto, mas rapidamente recuperaram com duas vitórias por 2-1, diante do 1º de Dezembro e do Atlético CP.
Os últimos três confrontos da época não resultaram em nenhuma vitória. No entanto, o empate na visita ao Caldas SC foi suficiente para garantir mais uma época na terceira divisão do futebol português. José Bizarro e Rui Mota foram os dois treinadores principais ao longo desta campanha. Bizarro abandonou o cargo após uma derrota em casa por 2-0 sobre o Amora, no início de novembro. Desde então, Rui Mota assumiu o leme da equipa.
Na Taça de Portugal, o Covilhã passou pelo Ovarense na primeira eliminatória, através do desempate nas grandes penalidades. Depois, recebeu e bateu o União Nogueirense com um golo solitário de André Liberal. Mas a prestação na competição terminou no próprio estádio diante do Lusitano de Évora. Os leões da serra sofreram dois golos sem resposta nos primeiros 26 minutos e não conseguiram reagir, culminando numa derrota por 2-0.
A nível de números, Liberal, emprestado pelo Paços de Ferreira, marcou a sua passagem no Covilhã ao ser o melhor marcador, com oito golos em 28 jogos. Gustavo Galil, guarda-redes, e Rodrigo Ferreira, médio, foram os mais utilizados, com 31 partidas disputadas.
